Chromofor, grupa atomów i elektronów tworzących część cząsteczki organicznej, która powoduje jej zabarwienie.
Korelacje między cechami strukturalnymi związków chemicznych a ich kolorami poszukiwano od około 1870 r., Kiedy zauważono, że chinony oraz aromatyczne związki azowe i nitrowe często są silnie zabarwione, a kolory ulegają zmniejszeniu lub zniszczeniu, gdy związki zostają uwodornione. Zdolność związku do przyjmowania wodoru, zwana nienasyceniem, jest spowodowana obecnością elektronów, które nie są silnie utrwalone w wiązaniach kowalencyjnych między poszczególnymi parami atomów, ale zajmują większe obszary przestrzeni (orbitale molekularne), które mogą być związane z kilkoma atomami. Te elektrony mogą pochłaniać energię światła w pewnym zakresie długości fal w obszarze widzialnym; przepuszczenie lub odbicie pozostałej części światła powoduje zaobserwowanie koloru związku. Głębokie zabarwienie występuje, jeśli kilka chromoforów jest ściśle połączonych w tej samej cząsteczce lub jeśli występuje inna grupa, zwana auksochromem.