W 16 wieku William I, książę Orange, został przywódcą holenderskiego ruchu niepodległościowego przeciwko Hiszpanii. Opierając się na ramionach swojego rodowego terytorium Orange, William zastosował barwne kolory: pomarańczowy, biały i niebieski. Podczas oblężenia Lejdy w 1574 r. Żołnierze nosili te kolory na mundurach, a następnie popularność kolorów wśród holenderskich nacjonalistów rozprzestrzeniła się. Prowincja Zelandii miała podobne kolory: jej flaga przedstawiała czerwonego lwa wyłaniającego się z niebiesko-białych pasów reprezentujących morze. Holenderska flaga na morzu po 1577 roku była pomarańczowo-biało-niebieska pozioma trójkolorowa, chociaż nigdy nie została oficjalnie przyjęta. Podobnie, nigdy nie było oficjalnego uznania zamiany pomarańczowej na czerwoną, transformacja zakończona do 1660 r. Był to właściwy czas, aby pominąć pomarańczową flagę, ponieważ w 1654 r. Traktat obronny między Holendrem a Anglikami został trwale wykluczony członkowie domu Orange od bycia głową państwa w Holandii. (W XX wieku wielu prawicowych Holendrów popierało pomarańczowo-biało-niebieski jako „autentyczną flagę” Holandii, ale flaga narodowa nie uległa zmianie).
Po rewolucji w 1789 r. Francuzi rozpoznali czerwony, biały i niebieski jako „kolory wolności” i uhonorowali Holandię za pierwsze użycie ich na fladze (patrz: flaga Francji). Pro-francuscy „patrioci” w Holandii zrobili pierwszy krok w kierunku oficjalnej holenderskiej flagi narodowej, kiedy ich Republika Batawska zalegalizowała czerwono-biało-niebieski trójkolorowy 14 lutego 1796 r. Kiedy brat Napoleona, Louis, został władcą Królestwa Holandia w 1806 roku, nie wprowadzono żadnych zmian w fladze narodowej. Holandia została aneksowana przez Francję w latach 1810–1813, ale po odzyskaniu niepodległości nowe Królestwo Niderlandów ponownie rozpoznało czerwono-biało-niebieską flagę. Flaga, ostatnio potwierdzona dekretem królewskim z 19 lutego 1937 r., Zainspirowała użycie tych samych kolorów do flag narodowych innych krajów. Pomimo wizualnego podobieństwa między flagą holenderską a flagą Luksemburga, nie ma udokumentowanego związku między tymi dwoma wzorami.
