John Knowles Paine (ur. 9 stycznia 1839, Portland, Maine, USA - zm. 25 kwietnia 1906, Cambridge, Massachusetts), kompozytor i organista, pierwszy Amerykanin, który zdobył szerokie uznanie jako kompozytor i pierwszy profesor muzyki w amerykański uniwersytet.
Po gruntownym gruntowaniu muzycznym w Portland Paine ukończył studia w Berlinie (1858–1861). W 1861 r. Zainicjował serię recitali organowych i wykładów w Bostonie, które doprowadziły do powołania go w 1862 r. Na instruktora (późniejszego profesora) muzyki na Uniwersytecie Harvarda. Dział muzyczny, który tam zorganizował, stał się wzorem dla wielu innych amerykańskich uniwersytetów.
Zarówno jako nauczyciel, jak i kompozytor miał duży wpływ na rozwój muzyki w Stanach Zjednoczonych. Do jego dzieł, wzorowanych ogólnie na niemieckich klasykach, należą dwie symfonie, msza w D (1866–67) i oratorium św. Piotra (1872).
