Michael Haydn, w całości Johann Michael Haydn (ochrzczony 14 września 1737 r., Rohrau, Austria - zmarł 10 sierpnia 1806 r. W Salzburgu), jeden z najwybitniejszych kompozytorów muzyki kościelnej pod koniec XVIII wieku. Był młodszym bratem Josepha Haydna.
Podobnie jak jego brat Michael Haydn został chórem chóru w katedrze św. Szczepana w Wiedniu, gdzie otrzymał wczesną naukę muzyki. Został zwolniony ze szkoły chóru, gdy złamał mu się głos, a następnie zarabiał na życie jako niezależny muzyk. W 1757 r. Został kapelmistrzem biskupa Grosswardeina na Węgrzech (obecnie Oradea, Rzym.), Aw 1762 r. Został koncertmistrzem arcybiskupa Salzburga. Do końca życia pozostał w Salzburgu jako koncertmistrz. W 1781 roku zastąpił Wolfganga Amadeusza Mozarta jako organisty katedralnego.
Za życia Michael Haydn był uważany za lepszego kompozytora muzyki kościelnej niż jego brat. Z wielu mszy, które napisał, Missa a due cori (znana również jako Missa Hispanica; 1786) jest wybitnym dziełem dla orkiestry i solistów wokalnych, a jego Requiem z 1771 roku wpłynęło na słynne Requiem Mozarta z 1791 roku. Haydn napisał także liczne symfonie, divertimenti i inne świeckie kompozycje. Był bliskim przyjacielem Mozarta (który napisał swoje duety skrzypcowo-altówkowe, aby wykonać zlecenie, których Haydn był zbyt chory, by ukończyć) i był nauczycielem Carla Marii von Webera. Po jego śmierci reputacja Haydna uległa długiemu zaćmieniu i dopiero po II wojnie światowej jego zasługi ponownie zostały uznane.
