Zanim Kosowo ogłosiło niepodległość 17 lutego 2008 r., Nigdy nie miało statusu politycznego, który pozwalałby na posiadanie własnej flagi. Po II wojnie światowej Kosowo zostało włączone do socjalistycznej Jugosławii jako autonomiczny region (później autonomiczna prowincja) Republiki Serbii. Rząd federalny zatwierdził flagi tylko dla kilku republik wchodzących w skład Jugosławii. Jednak etnicznym Albańczykom mieszkającym w Kosowie ostatecznie pozwolono latać pod banderą Albanii.
Kosowo pozostało częścią Serbii po rozpadzie socjalistycznej Jugosławii na początku lat 90., ale ruch separatystyczny w prowincji zyskał na sile przez dekadę. W 1998 r. Serbia podjęła działania karne przeciwko separatystom w Kosowie, które w 1999 r. Zostały przeciwstawione przez Organizację Traktatu Północnoatlantyckiego (NATO). Kosowo zostało objęte administracją Narodów Zjednoczonych, która pozostała tam po ogłoszeniu przez Kosowo proklamacji niepodległości w 2008 r., Aż w dużej mierze w 2009 r. Została zastąpiona przez urzędników Unii Europejskiej (UE). Serbia i wiele innych krajów pozostało przeciwnych tej deklaracji niepodległości.
Przeprowadzono formalny konkurs na flagę narodową dla Kosowa. Wiele wpisów opierało się na projekcie flagi Albanii, bezpośrednio lub pośrednio. Wybrany wzorzec - pod wpływem flagi UE - wyraźnie oświadczył, że Kosowo jest krajem wieloetnicznym. Niebieskie i żółte kolory flagi UE zostały użyte odpowiednio na tle flagi i sylwetce terytorium kraju, a okrąg białych gwiazd flagi UE był ustawiony równolegle do łuku białych gwiazd na fladze Kosowa. Mówi się, że gwiazdy reprezentują sześć dominujących grup etnicznych kraju (Albańczycy, Bośniacy, Gorani, Romowie, Serbowie i Turcy). Jednak etniczni albańscy i serbscy mieszkańcy Kosowa nadal używali swoich odpowiednich flag narodowych.
