Roderick MacKinnon, (ur. 19 lutego 1956 r., Burlington, Massachusetts, USA), amerykański lekarz, współtwórca Nagrody Nobla w dziedzinie chemii w 2003 r. Za pionierskie badania nad kanałami jonowymi w błonach komórkowych. Nagrodę dzielił z Peterem Agre, również ze Stanów Zjednoczonych.
MacKinnon uzyskał stopień doktora nauk medycznych w Tufts University School of Medicine w 1982 r. Po kilku latach praktykowania medycyny przeszedł do badań podstawowych, począwszy od 1986 r. Pracami podoktoranckimi nad kanałami jonowymi na Uniwersytecie Brandeis. W 1989 roku dołączył do Harvard University, aw 1996 roku przeniósł się na Rockefeller University jako profesor i kierownik laboratorium. Rok później został powołany na śledczego w Howard Hughes Medical Institute w Rockefeller.
Szczególnie ważne dla układu nerwowego i serca, kanały jonowe są wyspecjalizowanymi otworami w błonach komórkowych, które umożliwiają jonom, takim jak potas i sód, swobodny przepływ do i z komórek; podobne struktury istnieją również dla przepływu wody. Przełomowa praca MacKinnon koncentrowała się na „filtrach” w kanałach, które przepuszczały jeden rodzaj jonu, a jednocześnie blokowały inne. Aby zrozumieć, jak działają te filtry, uzyskał ostrzejsze obrazy kanałów za pomocą dyfrakcji rentgenowskiej. W 1998 roku określił trójwymiarową strukturę molekularną kanału jonowego. Kanał, jak odkrył MacKinnon, ma architekturę zwymiarowaną w taki sposób, że łatwo usuwa jony potasu - ale nie jonów sodu - z powiązanych cząsteczek wody i pozwala im się przedostać. Znalazł również molekularny „czujnik” na końcu kanału najbliższego wnętrzu komórki, który reaguje na warunki wokół komórki, wysyłając sygnały, które otwierają i zamykają kanał w odpowiednim czasie. Jego pionierska praca pozwoliła naukowcom kontynuować opracowywanie leków na choroby, w których rolę odgrywają kanały jonowe.
